はい、可能です。
CSVファイルに認証方式の名称列を追加し、インポート時のフィールド指定で認証方式に該当列を指定することでSAML認証をONの状態にしたユーザーを追加することができます。

※事前にLycheeSAMLの設定が完了していることが前提となります。